（一）经营场所检查
肥料经营者是否具备与其经营规模相适应的营业场所、仓储设施、安全防护和环境污染防治措施，防止肥料变质、失效，保证肥料质量。
（二）规章制度检查
1.肥料经营者是否依法依规建立了进货验收、索证制度。（对经营的肥料产品，应当向肥料生产或批发企业核对产品标签或使用说明书、产品质量合格证，留存其质量检验报告复印件。对实行生产许可、肥料登记的肥料产品，还应当留存其生产许可证、肥料登记证的复印件，以备查验。）
2.肥料经营者是否具有购销记录，购销记录是否完整、真实。（肥料购销记录应当载明肥料的通用名称、登记证号、执行标准号、规格、生产日期或批号、生产厂商、购销者名称、购销数量、购销日期等事项。）
3.肥料经营企业在销售肥料时向使用者提供肥料使用技术和说明安全使用注意事项等服务。
4.肥料经营者是否熟悉肥料方面的有关法律知识，接受各级农业行政主管部门组织的相关培训。
（三）销售的肥料包装及标识标签检查
1.肥料经营者销售的肥料是否具有质量合格证、包装是否完整、是否具有破损的情形。
2.肥料产品包装袋上是否具有标签，包括：以中文载明产品通用名称、生产企业名称和地址、产品所执行的标准号、产品有效成份的名称及含量、净含量、生产日期或产品批号、使用说明、实行生产许可管理的产品应当标明生产许可证号、实行肥料登记管理的产品应当标明肥料登记证号。有商品名称的，是否注明商品名称；对贮运和使用有特殊要求的，是否有警示标志或说明。
3.肥料经营者是否经营无肥料生产许可证、肥料登记证的；
4.肥料经营者是否经营包装上未印制标签或者未附具使用说明书的。
（四）安全检查
1.安全设施是否完善；
2.安全警示标识是否符合要求；
3.肥料堆放层高是否符合有关规定。