提出3方面的创新管理机制，支撑新材料大数据中心长期运营。一是中心主平台要建立开放透明的运行管理机制，组织研究提出建设总体规划和阶段性实施计划，统筹协调推进；二是研究建立数据资源节点分级会员制度，确定对非公共属性数据产品和服务的会员级别权限，构建数据资源节点内部评价和退出机制；三是通过市场、标准及技术等手段，逐步打通科技、产业等相关材料数据资源的融通和应用。
新材料大数据中心运营分为主平台和数据资源节点两个方面。主平台坚持公益性服务为主，向社会免费提供具有公共属性的基础产品，可根据发展需要探索商业化运营模式，开展数据要素市场化服务，并充分发挥新材料大数据创新联盟作用，鼓励和引导有关单位通过无偿捐赠、购买服务等方式支持运营。数据资源节点以商业化运营为主，重点发挥数据产品开发应用和推广功能，鼓励无偿提供具有公共属性的数据产品和服务；开展材料数据汇聚和数据产品开发应用，提供多类定制化数据产品，实现运营收益。